分公司倒闭后，总公司对员工的赔偿责任可能受以下特殊情形影响：
1. 若分公司具备独立法人资格，应先以自身财产承担赔偿责任，不足部分由总公司承担补充责任，而非总公司全额赔偿。
2. 若员工与分公司的劳动合同明确约定“分公司倒闭时总公司不承担赔偿责任”或“赔偿责任由分公司独立承担”，且该约定不违反法律强制性规定，员工需先向分公司主张权利。
3. 若分公司倒闭后依法清算注销，且已在清算中处理员工工资、经济补偿等债务，员工未在规定时间内申报债权，则分公司注销后，员工向总公司主张赔偿可能受限，总公司仅在清算遗漏债务范围内承担责任。
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分公司倒闭后，员工向总公司主张赔偿可能面临法律风险，影响权益实现：
1. 总公司或以“劳动关系主体不符”拒赔。若员工与分公司签订劳动合同，且分公司有独立营业执照并办理用工登记，总公司可能主张分公司具备用工自主权，拒绝赔偿。此时员工需举证分公司不具备法人资格，其责任应由总公司承担。
2. 总公司或以“员工已与其他单位建立劳动关系”拒赔。若分公司倒闭前，员工已被安排到总公司其他关联企业工作，且该关联企业为员工发放工资、缴纳社保，总公司可能主张员工与关联企业建立新劳动关系，与总公司无劳动关系，从而拒绝赔偿。
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分公司倒闭后，总公司是否需赔偿员工是劳动者关心的问题。一般情况下总公司需承担赔偿责任，具体如下：
1. 员工与分公司签订劳动合同，因分公司不具备法人资格，其民事责任由总公司承担。分公司倒闭导致劳动合同终止，总公司应支付经济补偿。
2. 员工与总公司直接签订劳动合同，分公司倒闭致使劳动合同无法履行，总公司作为用人单位，同样需向员工支付经济补偿。
3. 若分公司倒闭前已通过合法程序将员工劳动关系转移至其他关联公司，且员工同意，新用人单位继续履行原合同权利义务的，总公司可能无需承担赔偿责任。
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分公司倒闭后总公司是否赔偿员工，法律依据明确。根据《中华人民共和国劳动合同法》（2012年修正）第四十四条：“用人单位被依法宣告破产的，劳动合同终止。”第四十六条：“有下列情形之一的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿：（六）依照本法第四十四条第四项、第五项规定终止劳动合同的。”
分公司作为总公司分支机构，不具备独立法人资格，民事责任由总公司承担。分公司倒闭导致劳动合同终止，属于“用人单位被依法宣告破产”或“用人单位决定提前解散”等情形，符合第四十六条支付经济补偿条件。因此，无论员工与分公司还是总公司签订劳动合同，分公司倒闭后，总公司作为责任主体，应按法律规定向员工支付经济补偿。

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